8 февраля 2000 года газета "Санкт-Петербургские ведомости" опубликовала заявление инициативной группы Санкт-Петербургского университета по выдвижению Владимира Путина кандидатом в президенты, подвергнув критике выходившую на телеканале НТВ передачу "Куклы". По мнению заявителей, в передаче в "совершенно неприличном виде пародировались ведущие политические деятели страны
Чакра". Подписанты отмечали, что эти действия "могут служить красноречивым примером злоупотребления свободой слова". Сам кандидат через пресс-секретаря заявил, что "благодарен людям, выступающим в его защиту", но "не намерен предъявлять претензий".
21 августа 2000 года Минпечати вынесло предупреждение газете "Коммерсантъ", обвинив ее в злоупотреблении свободой СМИ и нарушении закона "О борьбе с терроризмом" в связи с публикацией интервью с лидером чеченских боевиков Асланом Масхадовым. Позже Тверской суд Москвы по жалобе редакции отменил предупреждение. 4 ноября 2003 года воронежские единороссы пожаловались в областной избирком на кандидата в депутаты Госдумы от партии СПС Александра Болдырева. Они обвинили соперника в злоупотреблении свободой массовой информации, выражавшемся в распространении листовок с надписью "Свободу Ходорковскому". Избирком не усмотрел нарушений в действиях кандидата.
19 августа 2006 года Ленинградский райсуд Калининграда по иску Росохранкультуры закрыл оппозиционную газету "Калининградские новые колеса". Как сообщил учредитель, депутат облдумы Игорь Рудников, издание обвинялось в "злоупотреблении свободой слова" и разглашении материалов следствия в связи с публикацией материалов о причастности сотрудников ФСБ к заказному убийству.